国内人才辈出却已经消失的大学1949年新中国成立前，中国13所教教会大学分别是燕京大学、齐鲁大学、东吴大学、圣约翰大学、之江大学、华西协和大学、华中大学、金陵大学、福建协和大学、华南女子文理学院、金陵女子文理学院、沪江大学 、岭南大学等。虽然数量不多，但起点很高。在当时的历史条件下，特别是在20世纪20年代以后，教会大学在中国教育近代化过程中起着某种程度的示范与导向作用。因为它在体制、机构、计划、课程、方法乃至规章制度诸多方面，更为直接地引进西方近代教育模式，从而在教育界和社会上产生颇为深刻的影响。
之江大学（Hangchow University）是教美北长老会和美南长老会在中国杭州联合创办的一所教会大学。前身为1845年于宁波创立的崇信义塾。1949年新中国成立前，中国共有13所教教会大学，之江大学也是中国的十三所教大学之一。
1916年秋天董事会推举司徒雷登的弟弟林 （Warren H. Stuart）为校长，聘请之大的老毕业生丁恺丰为教务长，增设学生奖学金及免费贷学金。1918年，校刊《之江潮声》出版。从1918年-1919年新建了两幢教员宿舍、一个礼拜堂（都克堂）、一座蓄水池、宿舍开始使用电灯，运动场落成了。华东大会、英语辩论会都在之大举行的。1920年林赴美国添聘教师，征募捐款，并向美国哥伦比亚特区立案，获准后施行新学制，分文理两科，分设天文、地理、生物、化学、中国语言与文学、数学、现代欧洲语言、哲学、物理、宗教、社会。1922年6月17日，举行毕业典礼上第一次颁发了学士学位，而且，学校还首次引进西方式的学位帽和礼服。1922年，林辞去职务，效董会推举费佩德（Robert Ferris Fitch）为校长，费佩德赴美募捐期间由王领赓代理。这一年校刊英文版创刊，中外文图书扩增1万多册，学生开始组织自治会。1923年，实行课外活动学分制，鼓励学生参加课外活动。
1951年，该校被浙江省文教厅接管，美籍教员离校回国。1952年因中国高校院系调整解散，院系拆分至浙江师范学院、浙江大学、复旦大学等，之江大学宣告结束。
燕京大学是近代中国最著名的教会大学之一，它本来是由华北地区的几所教会大学合并而成的，包括北京汇文大学、通州华北协和大学、北京华北女子协和大学，分别由美国长老会、美以美会、美国女公会、公理会、英国伦敦会等合办，初期名为“北京大学”。
1916年美国美以美会、公理会、美北长老会，英国伦敦会将三所教会学校合并，初名燕京大学，司徒雷登任校长。
1921年在北京西郊购买前清亲王赐园，聘建筑设计师墨菲进行总体规划，建造了近代中国规模最大、质量最高、环境最优美的一所校园。
1950年12月，政务院第65次政务会议通过决定：《接受美国津贴的文化教育救济机关及宗教团体》。
1951年1月11日，教育部又根据政务院的决定作了具体部署，并召开了一些会议，强调新中国不允许外国人在中国内办学校的方针。首批确定的改为公办的有11所，其中有燕京大学、协和医学院等；中国人自办，仍维持私立，政府给予补贴的有如沪江大学、东吴大学等。[10-11]
燕京大学民族学系、社会学系、语文系（民族语文系）、历史学系并入中央民族学院（今中央民族大学）；
新中国成立后，中央人民政府就筹划接收统治下的和外国人开办的各级学校，使教育尽快适应新中国的建设与需要，并陆续接受了一些人士的建议。
汇文大学合并后成立的在1952年被分拆，文、理部分科系并入北京大学、工程科系并入清华大学，由于当时“院系调整”规模较大，除院系外人事亦有很大调整，涉及全国几乎所有高等院校，其中一些调整在1952年以前已经开始，所有原教会背景学校于此时停办，院系及人员分拆进入其他大学。
齐鲁大学（Cheeloo University），简称齐大，诞生于1864年（清同治三年），由美北长老会、英国浸礼会共同发起，来自美国、英国以及加拿大的多个教教会联合开办。是中国最早的教会大学之一。经过长期发展，齐大发展成一所综合性教会大学。
齐鲁大学全盛时期，老舍、钱穆、顾颉刚、栾调甫、马彦祥、吴金鼎、胡厚宣等学术名家先后在此执教，号称“华北第一学府”，和燕京大学并称“南齐北燕”。
1952年院系调整，齐鲁大学被撤销建制，其学科分别并入山东大学、山东师范大学、学等高校，校园旧址为今山东大学趵突泉校区，校史由山东大学齐鲁医学院继承。虽然齐大和山大同处山东，但两者历史上少有关联，是不同性质、不同风格、相互独立的。
东吴大学（Soochow University）是中国第一所西制大学，由美国教监理会于1900年创办，前身是苏州的博习书院、宫项书院和上海中西书院。东吴大学最先开展法学（英美法）专业教育，是中国现存最早开展研究生教育并授予硕士学位的学校，并可授予博士学位，也是第一家创办学报的大学。首任校长为孙乐文（美籍）。1927年，杨永清当选为首任中国籍校长。
东吴大学设有文、理、法三个学院。文理学院设在苏州天赐庄，法学院设在上海昆山路。文学院曾设有中文系、历史系、经济系、系、社会系、教育系。理学院曾设有物理系、化学系、化工系、生物系、体育系，并附设医学预科、神学预科、化学研究所、生物研究所及生物材料处。法学院曾设有法律系、会计系、法学研究所。学制为预科三年、本科四年、研究生一年或两年，实行学分制。学校确定国文为学生必修课程，注重理科实验，并重视英文教学，教学质量在全国高校名列前茅。东吴大学的附属学校有苏州的第一中学、上海的第二中学、湖州的第二中学、无锡的第四中学、松江圣经学校以及二十几所附属小学。东吴大学办学半个多世纪以来，培养了许多著名学者和社会知名人士。
1952年，东吴大学的文理学院、苏南文化教育学院和江南大学的数理系合并组建苏南师范学院，同年更名为江苏师范学院，在原东吴大学校址办学，拥有东吴大学档案全宗。1982年，学校更名为苏州大学，英文校名恢复为Soochow University。东吴大学与苏州大学同宗同源，互为姊妹学校。
国立西南联合大学（National Southwestern Associated University），是中国抗日战争开始后高校内迁设于昆明的一所综合性大学。1937年11月1日，由国立北京大学、国立清华大学、私立南开大学在长沙组建成立的国立长沙临时大学在长沙开学（这一天也成为西南联大校庆日）。由于长沙连遭日机轰炸，1938年2月中旬，经中华教育部批准，长沙临时大学分三路西迁昆明。1938年4月，改称国立西南联合大学。从1937年8月中华教育部决定国立长沙临时大学组建开始，到1946年7月31日国立西南联合大学停止办学，西南联大前后共存在了8年零11个月，“内树学术自由之规模，外来堡垒之称号”，保存了抗战时期的重要科研力量，培养了一大批卓有成就的优秀人才，为中国和世界的发展进步作出了杰出贡献。1946年8月，三校复员北返后，西南联大师范学院留昆明联大旧址独立设置，定名国立昆明师范学院，1984年改称云南师范大学，其旧址现为全国重点文物保护单位、全国首批百个爱国主义教育示范基地、全国红色旅游经典景区、全国红色旅游精品线路、国家级海峡两岸交流基地、国家级抗战纪念设施遗址、全国免费开放博物馆、民盟中央传统教育基地、云南省社会科学普及示范基地、云南省国防教育示范基地等。2022年9月1日，西南联合研究生院在云南师范大学一二一西南联大校区成立。
大夏大学（The Great China University）是由1924年因从厦门大学脱离出来的三百余名师生在上海发起建立的一所综合性私立大学。初名大厦大学，“大厦”即“厦大”之颠倒，后来取“光大华夏”之意定名大夏大学。抗战期间先后内迁至庐山、贵阳、赤水，一度与复旦大学合并为中国历史上第一所联合大学，光复后迁回上海。1951年10月，在大夏大学原址上，大夏大学文、理、教育学科与光华大学相关系科合并成立华东师范大学，成为新中国创办的第一所师范大学。大夏首任校长是中国第一个在国外获得工学博士的化学家马君武。大夏主要创始人是欧元怀（第三任校长）、王毓祥、傅式说以及当时鼎立支持办学的政要王伯群。王伯群在上海捐资创办大夏大学，并担任学校董事长和第二任校长，集多年努力，将大夏大学发展成为时期著名的私立综合性大学，尤以建筑宏伟、环境优美、设施较完备和全国成立最早的教育学院而著称。厉麟似、吴泽霖、郭沫若、田汉、邵力子、何炳松、吴泽等知名学者均曾在大夏大学任教。大夏大学是国内最早实施导师制的大学，导师既关注学生的心智等训练和培养，也要关注学生对知识的理解，培养他们探索和创新精神。大夏大学也是较早实施通识教育的高校之一。譬如文科生除了国文、英文、历史等课程外，还要读涵盖化学、物理或生物的自然科学；理科生则要涉及英文及演说学、学、社会学等，学生“文理兼修”。良好的办学实力，使得大夏大学获享“东方的哥伦比亚大学”之美誉。
光华大学（Kwang Hua University）是时代上海一所著名的综合性私立大学，1925年6月由退出教会学校圣约翰大学的572名师生所创建，建校26载，培养了大批有为人才。在校学生最多时曾达1700余人，其中大学800余人，高初中900余人。至院系调整前，设有文、理、商三个学院和国文、外文、教育、社会、法律、数理、化学、生物、土木工程、经济、工商管理、会计、银行、铁路工程十四个系科。胡适、厉麟似、徐志摩等著名学者都曾在该校任教。1951年10月，除商、法和土木等系科外，其文、理科与大夏大学等校的相关科系合并成立华东师范大学，成为新中国创办的第一所师范大学。光华大学1925年至1951年的档案全宗及光华附中的部分档案也一并移交华东师大。1985年3月10日，光华大学校友会在华东师大正式成立。华东师范大学自2011年60周年校庆起，将光华大学建校日（6月3日）确定为学校每年的纪念日。1938年初，光华大学在抗战烽火中内迁成都办学，设立光华大学成都分部。1941年末，上海本部对外改称诚正文学社和格致理商学社，成都分部承担起总校职能。1945年抗战胜利后，上海本部得以恢复，成都分部交四川省地方接办，更名为私立成华大学。1952年10月，私立成华大学改为公立，并以成华大学为基础先后调入西南地区16所财经院校、综合大学的财经系科组建四川财经学院（今西南财经大学）。2012年8月，西南财经大学将建校时间确定为1925年6月3日光华大学成立之时。
燕京大学（Yenching University）创办于1919年，由美国及英国教教会在北京联合开办，是近代中国规模最大、质量最好、环境最优美的大学之一。创始人司徒雷登长期担任燕大校长、校务长，他将燕大的校训确定为“因线年春，燕京大学与美国哈佛大学合作成立哈佛燕京学社，到1930年代已经跻身于世界一流大学之列。1942年至1945年，因太平洋战争爆发而被侵华日军封闭的燕京大学曾内迁成都办学，抗战胜利后回到北平复校。在中国高校1952年院系调整中，燕京大学被撤销。在香港，教教会代表1951年创办了旨在继承燕大等13所内地教会大学精神的崇基学院（后成为香港中文大学成员学院之一）。在中国，其资产由中华人民共和国中央人民政府接管后被整并，文科、理科多并入北京大学，工科并入清华大学，学系并入北京政法学院（今中国政法大学），社会学系并入中央民族学院，宗教学院1950年已独立办学（今燕京神学院）。校舍由北京大学接收，其建筑仍为燕京大学古迹。燕大诞生于五四时期，作为当时中国高等教育的重要代表，一开始便与学生爱国运动结下不解之缘。这所大学在教育方法、课程设置、规章制度诸多方面，对中国近代高等教育的发展产生了深刻影响。没有哪所大学能像燕京大学一样，对中国的介入如此之深，以至于研究中国近现代史都无法绕开燕京大学。五四运动、西安事变、国共内战、等多次近的重大事件，都和燕大有关。
东吴大学（Soochow University）是中国第一所西制大学，由美国教监理会于1900年创办，前身是苏州的博习书院、宫项书院和上海中西书院。东吴大学最先开展法学（英美法）专业教育，是中国现存最早开展研究生教育并授予硕士学位的学校，并可授予博士学位，也是第一家创办学报的大学。首任校长为孙乐文（美籍）。1927年，杨永清当选为首任中国籍校长。东吴大学设有文、理、法三个学院。文理学院设在苏州天赐庄，法学院设在上海昆山路。文学院曾设有中文系、历史系、经济系、系、社会系、教育系。理学院曾设有物理系、化学系、化工系、生物系、体育系，并附设医学预科、神学预科、化学研究所、生物研究所及生物材料处。法学院曾设有法律系、会计系、法学研究所。学制为预科三年、本科四年、研究生一年或两年，实行学分制。学校确定国文为学生必修课程，注重理科实验，并重视英文教学，教学质量在全国高校名列前茅。东吴大学的附属学校有苏州的第一中学、上海的第二中学、湖州的第二中学、无锡的第四中学、松江圣经学校以及二十几所附属小学。东吴大学办学半个多世纪以来，培养了许多著名学者和社会知名人士。1952年，东吴大学的文理学院、苏南文化教育学院和江南大学的数理系合并组建苏南师范学院，同年更名为江苏师范学院，在原东吴大学校址办学，拥有东吴大学档案全宗。1982年，学校更名为苏州大学，英文校名恢复为Soochow University。东吴大学与苏州大学同宗同源，互为姊妹学校。
震旦大学，原名震旦学院，由马相伯神父于1903年2月27日在上海徐家汇天文台旧址创办，是中国近代一所私立大学。“震旦”一词出自梵文，意即中国，在英语中，亦有黎明、曙光的含义。马相伯将震旦学院喻作旭日东升，担负着以教育开启中国曙光的重任。1905年春，由于天主教耶稣会干涉校政，马相伯带领震旦爱国师生出走成立复旦公学。马相伯是震旦大学的首任校长、董事长和终身校董，尽管同耶稣会有矛盾，仍然是震旦的主要捐助人，并在有生之年运用他的影响支持震旦。1908年迁址卢家湾。1928年改称震旦大学。英、法文校名分别为Aurora University和Université lAurore。震旦大学为中国近代著名教会大学，曾经有“东方巴黎大学”美誉，是中国第一所开展研究生教育并授予博士和硕士学位的学校，拥有中国第一家博物馆“震旦博物院”（上海自然博物馆前身）。至1947年，震旦大学设有医学院、理工学院、法学院、文学院、震旦女子文理学院和两所附属中学，并附设两所高级学校。1952年秋，在全国高校院系调整中，震旦大学被撤销，其医学院和圣约翰大学医学院、同德医学院在原址合并成立上海第二医学院；其余系科分别并入复旦大学B体育、上海第一医学院、华东师范大学、交通大学、同济大学、华东化工学院、华东政法学院、上海财政经济学院、学、南京师范学院；震旦附中和震旦女附中在震旦女子文理学院原址合并改为上海市向明中学。震旦大学原址现为重庆南路227号和280号上海交通大学医学院校舍。
齐鲁大学（Cheeloo University），简称齐大，诞生于1864年（清同治三年），由美北长老会、英国浸礼会共同发起，来自美国、英国以及加拿大的多个教教会联合开办。是中国最早的教会大学之一。经过长期发展，齐大发展成一所综合性教会大学。齐鲁大学全盛时期，老舍、钱穆、顾颉刚、栾调甫、马彦祥、吴金鼎、胡厚宣等学术名家先后在此执教，号称“华北第一学府”，和燕京大学并称“南齐北燕”。学校以医学院实力最强，坊间有“北协和、南湘雅、东齐鲁、西华西”之称。齐鲁大学校长、哈佛大学毕业生刘世传曾说：“正如我的另一个母校，哈佛大学是美国最老的大学一样，齐大是中国最老的大学，绝对没有一个中国大学能在这一点上赶上齐大！”1952年院系调整，齐鲁大学被撤销建制，其学科分别并入山东大学、山东师范大学、学等高校，校园旧址为今山东大学趵突泉校区，校史由山东大学齐鲁医学院继承。虽然齐大和山大同处山东，但两者历史上少有关联，是不同性质、不同风格、相互独立的。齐鲁大学旧址于2013年3月被国务院核定为第七批全国重点文物保护单位“原齐鲁大学近现代建筑群”，编号7-1783-5-176。
金陵大学（University of Nanking），简称“金大”，诞生于清光绪十四年（1888年）的美国教会美以美会（卫斯理会，Methodist Church）在南京创办的教会大学，同美国康奈尔大学为姊妹大学。当时社会评价为“中国最好的教会大学”，享有“江东之雄”、“钟山之英”之美誉。厉麟似、胡小石、赛珍珠等著名学者都曾在金大任教。1928年金陵大学首先向教育部注册并批准。在美国加利福尼亚大学对外人在华所办大学编类中，金陵大学是中国教会大学中唯一的A类，持有金大学位的毕业生有资格直接进入美国大学的研究生院。金陵大学有文理农三院，英语文学和中国文化研究成就卓著，闻名世界。尤其农林学科堪称中国之先驱，享誉海内外。其他方面亦有发展，如开创中国电影教育、首开中国医科七年制教育和博士教育。金大培养大批优秀人才分布于海内外，在各个领域内发挥所长，使金大饮誉国内外，在中国近代教育史上具有重要影响。为中国现代大学教育的建立与发展、现代科学技术的引进、新的人才培养模式的开创、优秀人才的输送都做出了突出贡献。1951年，私立金陵大学与私立金陵女子文理学院合并为公立金陵大学。1952年院系调整，金陵大学被撤销建制，文、理学院等并入学合并，部分院系参与组建中国其他高校。其历史档案划归学。学将校址从四牌楼旧址迁至金陵大学鼓楼校址。
圣约翰大学（St. Johns University），简称圣约翰、约大，诞生于1879年，初名圣约翰书院。1881年成为中国首座全英语授课的学校。1892年起开设大学课程，1905年升格为大学，是中国第一所现代高等教会学府。1913年开始招收研究生。至1949年春，设有文、理、医、工、神5个学院和附属中学。1952年，约大有教职员工234人，在校学生1381人；校园面积达348亩，建有校舍楼馆、住宅约50所。圣约翰大学是当时上海乃至中国最优秀的大学之一，也是在华办学时间最长的一所教会学校。美国多所名牌大学皆承认约大学生的学历，并给予直升其研究生院的优待。卜舫济主持圣约翰校政长达53年之久，对学校的发展起到很大影响。该校师生具有反清、反殖义的光荣传统，上海历次的学生，都有约大学生积极参加。73年的办学历程中，圣约翰大学享有“东方哈佛”、“外交人才的养成所”等盛名，更是培育出了一大批声名显赫的校友。1949年秋，新闻系并入复旦大学。1952年院系调整，圣约翰大学被撤销，理学院（数学系、物理系、化学系、生物系）、教育系、中文系（部分）并入华东师范大学；外文系、中文系（部分）、历史系并入复旦大学；土木工程系、建筑工程系并入同济大学；机械工程系并入交通大学；医学院参与组建上海第二医学院；经济系并入上海财政经济学院；系和校址划归华东政法学院；附中并入上海市五四中学。自2015年起，圣约翰大学北京、上海、南京校友会先后成为华东师范大学校友会的备案组织。
四川大学华西医学中心（West China Medical Center, Sichuan University），位于四川省成都市，是四川大学下设医学中心，是国家首批“卓越医生教育培养计划”项目试点高校，是教育部、卫生部首批共建高校医学院的十所部属综合性大学医学院之一，首批试办临床医学八年制的五所院校之一，医学“双一流”建设联盟创始成员之一。四川大学华西医学中心下设华西基础医学与法医学院、华西临床医学院（华西护理学院）、华西口腔医学院、华西公共卫生学院、华西药学院以及四所直属医院：华西医院、华西第二医院、华西口腔医院、华西第四医院。华西医学中心前身私立华西协合大学由美国、英国、加拿大等5个教会组织在成都华西坝创办创办于1910年3月11日，历经华西大学、四川医学院、华西医科大学等阶段，于1998年成为首批4所“211工程”医学类院校之一。2000年9月四川大学和华西医科大学合并，组建新四川大学，华西医科大学更名为四川大学华西医学中心。截至2024年5月官网显示，四川大学华西医学中心占地1100余亩，设有5个学院，4所直属医院，全日制本科生4500余人，研究生3600余人，教职工及医务人员1.5万余人。医学国家级重点学科16个，国家临床重点专科项目45个，入选国家“双一流”建设学科3个，博士学位一级学科授权点10个，本科专业17个，硕士点76个，博士点57个，博士后流动站10个。3个一级学科入选国家“双一流”建设学科。
辅仁大学简称辅大。旧称：辅仁社、北京公教大学、私立北京辅仁大学、私立北平辅仁大学、国立辅仁大学。分国立和私立两种。其中私立北京/北平辅仁大学是时期高校，创始人之一同为震旦大学、复旦大学的创始人马相伯先生。1952年院系调整，辅仁大学的中文、西语、数学、物理、化学、史学、生物、教育、心理9个系并入北京师范大学，哲学、西语（四年级）2个系并入北京大学，经济与社会学系并入中国人民大学，社会学系内务组并入中国政法大学。1952年之后，辅仁大学校长陈垣先生就任北京师范大学校长。辅大曾与20世纪初的北京大学、清华大学、燕京大学并称北平四大名校。
岭南大学（Lingnan University）前身为格致书院，由美国教长老会于1888年在广州创办。1925～1927年广州处于大，该校工人、学生连续、，1927年4月学校宣布停办。当时以钱树芬为首的一批爱国校友倡议接办学校，同年7月经广东政府批准，学校收归中国人自办，并正式改名私立岭南大学。1951年，前校长李应林用岭南大学美国基金会以及燕京大学、金陵大学、沪江大学、圣约翰大学等13家教会大学在香港的存款，筹办了崇基学院（今属香港中文大学），代表教在华发展高等教育传统的延续。1952年，岭南大学在院系调整中与国立中山大学及其他院校的相关专业合并，组成中山大学、华南理工大学等。岭南大学于1967年9月由岭南大学校友在香港复建，时称岭南书院，后于1999年正名为岭南大学，现为香港八所著名公立大学之一。
之江大学（Hangchow University）是教美北长老会和美南长老会在中国杭州联合创办的一所教会大学。